Chefirul din lapte are numeroase beneficii pentru sănătate, reprezintă o bogată sursă de calciu, magneziu, fier și iod, componente importante pentru oase, dinți, mușchi și sistemul nervos. În plus, pe lângă proteine, conține vitamine A, D, B și K. Pe lângă bacteriile obișnuite, prezente în acizii lactici, drojdii și bacterii specifice chefirului: aceste microorganisme ajută flora intestinală, luptă împotriva agenților patogeni și sporesc, astfel, imunitatea organismului, scade colesterolul, activitate antitumorală (ex cancer) etc